Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLA2Q9P2R7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUCLA2Q9P2R7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUCLA2Q9P2R7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms