Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPZ2Q9P299 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COPZ2Q9P299 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms