Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HMG20BQ9P0W2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMG20BQ9P0W2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms