Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC59Q9P031 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms