Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-207ENST00000506985 2399 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.237e-8■■■■■ 365.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-205ENST00000505388 606 ntTSL 44.57□□□□□ -1.687e-8■■■■■ 365.5
UTP3Q9NQZ2 RHBDD1-212ENST00000483268 472 ntTSL 49.55□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 365.4
UTP3Q9NQZ2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.072e-11■■■■■ 365.4
UTP3Q9NQZ2 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-11■■■■■ 365.4
UTP3Q9NQZ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-24■■■■■ 365.3
UTP3Q9NQZ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-24■■■■■ 365.3
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 365.2
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 365.2
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 365.2
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 365.2
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-209ENST00000509236 619 ntTSL 511.62□□□□□ -0.554e-16■■■■■ 364.9
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-203ENST00000428382 249 ntTSL 48.71□□□□□ -1.024e-16■■■■■ 364.9
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-208ENST00000507513 425 ntTSL 37.89□□□□□ -1.154e-16■■■■■ 364.9
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-214ENST00000515488 587 ntTSL 46.17□□□□□ -1.424e-16■■■■■ 364.9
UTP3Q9NQZ2 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.822e-15■■■■■ 363.9
UTP3Q9NQZ2 POLR2A-206ENST00000576553 602 ntTSL 222.14■■□□□ 1.135e-12■■■■■ 363.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.742e-19■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-19■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-13■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-227ENST00000636825 3020 ntTSL 58.04□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-221ENST00000635830 3237 ntTSL 58.03□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 RAD54B-203ENST00000463267 1699 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.311e-13■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-226ENST00000636784 100 ntTSL 53.76□□□□□ -1.816e-7■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 515.18■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 414.39□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-214ENST00000565328 582 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 511.19□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 363.3
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 218.47■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 362.5
UTP3Q9NQZ2 FUNDC2-204ENST00000475165 532 ntTSL 39.93□□□□□ -0.826e-37■■■■■ 362.3
UTP3Q9NQZ2 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-13■■■■■ 362.2
UTP3Q9NQZ2 PDGFA-205ENST00000426681 357 ntTSL 525.06■■□□□ 1.65e-9■■■■■ 361.5
UTP3Q9NQZ2 PDGFA-204ENST00000405692 663 ntTSL 522.18■■□□□ 1.145e-9■■■■■ 361.5
UTP3Q9NQZ2 EML3-207ENST00000460939 1770 ntTSL 524.8■■□□□ 1.569e-21■■■■■ 361.3
UTP3Q9NQZ2 EML3-211ENST00000483199 1042 ntTSL 322.78■■□□□ 1.249e-21■■■■■ 361.3
UTP3Q9NQZ2 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.22■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 361.2
UTP3Q9NQZ2 UBTF-211ENST00000530828 721 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-21■■■■■ 361
UTP3Q9NQZ2 GTPBP1-210ENST00000484971 582 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 360.8
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-207ENST00000526374 591 ntTSL 222.14■■□□□ 1.136e-43■■■■■ 360.2
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-221ENST00000532639 748 ntTSL 518.29■□□□□ 0.526e-43■■■■■ 360.2
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-228ENST00000621027 1318 ntTSL 216.54■□□□□ 0.246e-43■■■■■ 360.2
UTP3Q9NQZ2 BANP-221ENST00000497491 739 ntTSL 515.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 360.2
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-217ENST00000530708 874 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-43■■■■■ 360.2
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-211ENST00000527259 495 ntTSL 38.91□□□□□ -0.986e-43■■■■■ 360.2
UTP3Q9NQZ2 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 326.52■■□□□ 1.843e-8■■■■■ 359.9
UTP3Q9NQZ2 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 526.52■■□□□ 1.843e-8■■■■■ 359.9
UTP3Q9NQZ2 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 419.43■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 359.5
UTP3Q9NQZ2 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 359.5
UTP3Q9NQZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.31e-10■■■■■ 359.1
UTP3Q9NQZ2 CUL2-205ENST00000374754 4440 ntTSL 517.34■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 358.1
UTP3Q9NQZ2 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 358.1
UTP3Q9NQZ2 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 358.1
UTP3Q9NQZ2 CUL2-202ENST00000374748 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 358.1
UTP3Q9NQZ2 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 358.1
UTP3Q9NQZ2 CUL2-207ENST00000468804 479 ntTSL 310.02□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 358.1
UTP3Q9NQZ2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 357.5
UTP3Q9NQZ2 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 517.77■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 357.5
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-208ENST00000598415 715 ntTSL 224.29■■□□□ 1.482e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-212ENST00000602075 763 ntTSL 324.29■■□□□ 1.482e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-210ENST00000600559 550 ntTSL 222.58■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 12e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-206ENST00000598090 463 ntTSL 321.29■■□□□ 12e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-211ENST00000601135 723 ntTSL 219.57■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-213ENST00000602201 556 ntTSL 418.42■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-202ENST00000593561 546 ntTSL 417.86■□□□□ 0.452e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-207ENST00000598200 465 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 357.4
UTP3Q9NQZ2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 357.3
UTP3Q9NQZ2 DDX46-211ENST00000513987 543 ntTSL 310.46□□□□□ -0.735e-34■■■■■ 357.1
UTP3Q9NQZ2 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 356.9
UTP3Q9NQZ2 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 356.9
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.815e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-204ENST00000417962 2306 ntTSL 220.2■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-212ENST00000465449 1739 ntTSL 219.34■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-216ENST00000494854 1908 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-213ENST00000466424 673 ntTSL 212.34□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 356.1
UTP3Q9NQZ2 SLC35E2B-202ENST00000481276 2199 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 356
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)25.37■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 355.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)25.37■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 355.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 355.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 355.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 355.8
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-205ENST00000578658 563 ntTSL 58.06□□□□□ -1.123e-8■■■■■ 355.5
UTP3Q9NQZ2 CARM1-209ENST00000590699 2240 ntTSL 530.11■■■□□ 2.412e-6■■■■■ 355.4
UTP3Q9NQZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.972e-6■■■■■ 355.4
UTP3Q9NQZ2 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 355.4
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