Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 29.8
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EXOSC5Q9NQT4 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 29.8
EXOSC5Q9NQT4 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 510.37□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 29.8
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EXOSC5Q9NQT4 FAM172A-205ENST00000506398 965 ntTSL 58.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 29.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM172A-203ENST00000504768 803 ntTSL 53.45□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 29.8
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EXOSC5Q9NQT4 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 29.8
EXOSC5Q9NQT4 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 34.62□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 29.8
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-215ENST00000461603 612 ntTSL 44.66□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-209ENST00000636335 1219 ntTSL 512.56□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-203ENST00000369070 3088 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -21e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-216ENST00000627864 581 ntTSL 315.44■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-211ENST00000496908 342 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-204ENST00000415944 413 ntTSL 57.67□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-202ENST00000369957 784 ntTSL 37.48□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-220ENST00000631210 490 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-219ENST00000630151 322 ntTSL 55.19□□□□□ -1.588e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-222ENST00000637533 140 ntTSL 51.73□□□□□ -2.138e-7■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 29.7
EXOSC5Q9NQT4 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 CEBPZ-203ENST00000489306 611 ntTSL 24.27□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 316.33■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 215.35■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 314.33□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 513.59□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 213.34□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 211.02□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.676e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 EXOC4-211ENST00000478265 595 ntTSL 44.44□□□□□ -1.76e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.748e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.48e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 ADIPOR2-204ENST00000537545 484 ntTSL 36.67□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 PI4KA-203ENST00000449120 574 ntTSL 414.09□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 29.6
EXOSC5Q9NQT4 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.836e-8■■■■■ 29.6
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EXOSC5Q9NQT4 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-221ENST00000545737 1578 ntTSL 1 (best)4.62□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-206ENST00000564328 2323 ntTSL 517.49■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-209ENST00000567808 520 ntTSL 316.12■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-210ENST00000569159 531 ntTSL 415.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-208ENST00000567337 555 ntTSL 413.23□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 48.59□□□□□ -1.039e-8■■■■■ 29.5
EXOSC5Q9NQT4 OXCT1-201ENST00000196371 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 SLC7A11-202ENST00000509248 797 ntTSL 53.79□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-206ENST00000476558 1819 ntTSL 219.9■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-210ENST00000545067 4001 ntTSL 1 (best)7.73□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.783e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.863e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.863e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-211ENST00000638889 423 ntTSL 32.7□□□□□ -1.983e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.373e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 HIBADH-203ENST00000428288 1669 ntTSL 317.57■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 HIBADH-202ENST00000425715 618 ntTSL 211.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 29.4
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