Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH12Q9NPG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms