Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD248Q9HCU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD248Q9HCU0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms