Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP62CLQ9H1M0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUP62CLQ9H1M0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms