Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C20orf27Q9GZN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C20orf27Q9GZN8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms