Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPL3Q9BY60 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms