Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB2BQ9BVA1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB2BQ9BVA1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB2BQ9BVA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB2BQ9BVA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB2BQ9BVA1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB2BQ9BVA1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms