Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D3Q9BRN9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM2D3Q9BRN9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms