Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 MRPL28-210ENST00000483764 1512 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 MRPL28-206ENST00000450882 619 ntTSL 318.19■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 29.6
BUD13Q9BRD0 WDR60-201ENST00000397143 457 ntTSL 313.25□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 29.5
BUD13Q9BRD0 SZT2-205ENST00000470139 4098 ntTSL 29.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 29.5
BUD13Q9BRD0 ESPN-203ENST00000418286 641 ntTSL 317.48■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 29.5
BUD13Q9BRD0 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 TINAGL1-209ENST00000481165 4759 ntTSL 217.1■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-222ENST00000488479 539 ntTSL 424.12■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-216ENST00000470910 1005 ntTSL 223.77■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-207ENST00000427459 553 ntTSL 422.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-214ENST00000466443 544 ntTSL 422.16■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-208ENST00000431601 2346 ntTSL 520.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-212ENST00000452389 2933 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-211ENST00000441302 3240 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-205ENST00000419156 814 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 GORASP1-213ENST00000453680 2873 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 PGK1-205ENST00000491291 702 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-10■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.292e-10■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-10■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 WDR74-213ENST00000542347 988 ntTSL 219.76■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 29.4
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 527.51■■□□□ 1.992e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 PKM-217ENST00000566809 560 ntTSL 422.17■■□□□ 1.143e-16■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 PKM-223ENST00000569050 457 ntTSL 420.7■□□□□ 0.93e-16■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 TOMM40-206ENST00000592041 707 ntTSL 218.52■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 315.34■□□□□ 0.052e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.052e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 313.98□□□□□ -0.173e-16■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 512.16□□□□□ -0.463e-16■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.482e-21■■■■■ 29.3
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BUD13Q9BRD0 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 211.8□□□□□ -0.523e-16■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 511.38□□□□□ -0.593e-16■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.322e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 56.66□□□□□ -1.342e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 55.82□□□□□ -1.482e-21■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RPS3A-203ENST00000505243 614 ntTSL 321.89■■□□□ 1.093e-11■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RPS3A-202ENST00000503002 480 ntTSL 316.17■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RPS3A-207ENST00000508783 587 ntTSL 315.82■□□□□ 0.123e-11■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.718e-9■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.568e-9■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 COL7A1-203ENST00000459756 818 ntTSL 518.5■□□□□ 0.558e-9■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 TNS1-208ENST00000439083 538 ntTSL 516.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 312.7□□□□□ -0.388e-9■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 RUVBL1-205ENST00000478892 872 ntTSL 311.82□□□□□ -0.528e-9■■■■■ 29.3
BUD13Q9BRD0 ZNF767P-205ENST00000493198 501 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 ZNF767P-203ENST00000481762 357 ntTSL 39.58□□□□□ -0.889e-11■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.013e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 ASB3-211ENST00000482829 1910 ntTSL 513.56□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 ASB3-203ENST00000406053 2648 ntTSL 56.49□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 PMFBP1-206ENST00000537392 2038 ntTSL 29.96□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 VPS28-206ENST00000526734 570 ntTSL 223.62■■□□□ 1.377e-7■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 VPS28-215ENST00000531924 695 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 COL7A1-210ENST00000487017 5807 ntTSL 517.64■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GSDMD-211ENST00000531184 2213 ntTSL 222.33■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GSDMD-215ENST00000534018 1101 ntTSL 519.62■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 29.2
BUD13Q9BRD0 TMEM8A-205ENST00000448854 858 ntTSL 216.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 TMEM8A-206ENST00000467452 646 ntTSL 213.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-216ENST00000622878 556 ntTSL 418.49■□□□□ 0.559e-21■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 216.76■□□□□ 0.276e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 216.47■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 515.34■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-15■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 313.46□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 513.34□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 212.7□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-210ENST00000615695 897 ntTSL 211.77□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 29.32□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 29.1
BUD13Q9BRD0 COL16A1-212ENST00000482478 797 ntTSL 318.05■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 29
BUD13Q9BRD0 COL16A1-210ENST00000474000 676 ntTSL 514.18□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 29
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