Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MIPEPQ99797 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIPEPQ99797 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms