Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN18Q96SJ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN18Q96SJ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms