Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UIMC1Q96RL1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UIMC1Q96RL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms