Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP5Q96PP8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBP5Q96PP8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP5Q96PP8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms