Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF6Q96J87 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF6Q96J87 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms