Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCED1BQ96HM7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCED1BQ96HM7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCED1BQ96HM7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms