Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RMDN1Q96DB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms