Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKD2Q969F2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKD2Q969F2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms