Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY2Q8WXA3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms