Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDI1Q8WTU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDI1Q8WTU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDI1Q8WTU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDI1Q8WTU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDI1Q8WTU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms