Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP38Q8NB14 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP38Q8NB14 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms