Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC117Q8IWD4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC117Q8IWD4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms