Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML1Q86YW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms