Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms