Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARM1Q6SZW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARM1Q6SZW1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms