Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN3Q6P5Z2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKN3Q6P5Z2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKN3Q6P5Z2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms