Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRGCQ6NXR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms