Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDPF1Q6NVV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDPF1Q6NVV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms