Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1DP3Q658K8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms