Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF3Q5VWG9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms