Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC39AQ5SRH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTC39AQ5SRH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC39AQ5SRH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms