Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITRM1Q5JRX3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITRM1Q5JRX3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITRM1Q5JRX3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms