Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-BQ31612 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms