Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC6LQ2NKX8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms