Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKIDA1Q1XH10 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKIDA1Q1XH10 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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