Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA6Q16445 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GABRA6Q16445 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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