Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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