Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP1Q13835 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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