Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE3BQ13370 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
PDE3BQ13370 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE3BQ13370 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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