Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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ERCC8Q13216 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ERCC8Q13216 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ERCC8Q13216 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERCC8Q13216 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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ERCC8Q13216 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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