Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNB2Q03252 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms