Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms