Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT83P78385 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT83P78385 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT83P78385 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT83P78385 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT83P78385 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT83P78385 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT83P78385 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT83P78385 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT83P78385 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT83P78385 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT83P78385 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT83P78385 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT83P78385 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT83P78385 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT83P78385 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT83P78385 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT83P78385 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT83P78385 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT83P78385 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT83P78385 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT83P78385 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms