Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBX1P62877 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBX1P62877 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBX1P62877 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBX1P62877 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBX1P62877 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBX1P62877 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBX1P62877 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBX1P62877 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBX1P62877 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBX1P62877 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms