Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNRPEP62304 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNRPEP62304 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNRPEP62304 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPEP62304 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms