Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms